O restauro de bens culturais só deve ser efectuado por técnicos especializados e habilitados para o efeito, ou por eles orientados, em conjugação com os responsáveis da Instituição. O Museu Quinta das Cruzes, tem procurado parcerias e consultadorias técnicas no âmbito da conservação e do restauro de bens culturais à sua guarda, procedendo ao acompanhamento e colaboração em todas as fases do processo de intervenção.
Nos últimos anos, realizaram-se, de forma faseada, várias campanhas de restauro, no âmbito do apoio financeiro institucional, proporcionado pelos Projectos PIDDAR E POPRAM III /FEDER.
O Museu tem procedido ao levantamento sistemático do estado de conservação do seu espólio e procedido, de uma forma faseada, ao restauro de alguns núcleos e/ou peças isoladas.