O Museu Quinta das Cruzes garante as condições adequadas e promove as medidas preventivas necessárias à conservação dos bens culturais que se encontram à sua guarda, de acordo com as normas e orientações técnicas veiculadas pelas entidades competentes nesta matéria.
A conservação do edifício e dos bens culturais que constituem o espólio do Museu, obedece ao Plano de Conservação Preventiva do Museu Quinta das Cruzes, elaborado de acordo com as especificidades próprias da Instituição, procurando definir os princípios e prioridades no âmbito da conservação preventiva e a implementação dos respectivos procedimentos.